Administra los procesos académico-administrativos necesarios para el desarrollo de estas funciones y mantiene articulación permanente con la Decanatura y otras instancias institucionales mediante el suministro de información para la toma de decisiones. Asimismo, coordina las actividades académicas del profesorado adscrito a sus secciones y colabora con el Área Curricular en la programación y asignación de actividades docentes. Coordina las Secciones de Odontopediatría, Rehabilitación Oral, y los posgrados de Ortodoncia, Rehabilitación Oral, Estomatología Pediátrica y Ortopedia Maxilar, Operatoria Dental Estética y Maestría en Odontología.
El Departamento de Salud Oral participa en los siguientes Comités: Comité de Directores de Departamento, Comité de Asuntos del Personal Académico, Comité de Área Curricular, Comité de Posgrados, Comité Técnico – Científico y Ética Hospitalaria, Comité de Vigilancia Epidemiológica y Control de Infecciones – COVIECIDE, Comité de Evaluación Interna.
De acuerdo con lo establecido en el Estatuto General de la Universidad Nacional de Colombia, Acuerdo 11 de 2005 del Consejo Superior Universitario: El Departamento es la comunidad natural de los docentes donde se conciben y programan las actividades propias de la profesión académica, como la docencia, la investigación y la extensión.
El Departamento de Salud Oral aparece en la Facultad de Odontología como producto del Acuerdo 010 de 2000 y del Acuerdo 019 de 2001, del Consejo Superior Universitario, referentes a la organización de las Facultades. Estos acuerdos generaron las Unidades Académicas Básicas de Gestión Académico-Administrativa. Por Resolución N° 054 de 2002 del Consejo de Facultad se reglamenta la estructura académico administrativa de la Facultad de Odontología de la Sede Bogotá, según el acuerdo 003 de 2002 del Consejo Superior Universitario.
En la Facultad se constituyeron el Departamento de Salud Oral y el de Salud Colectiva. Posteriormente mediante el Acuerdo 014 de 2008 – (numeral 7) se conformó el Departamento de Ciencias Básicas y Medicina Oral como Unidad Académica Básica .